傘はマンジュウ型で、開けば平らになります。　キズをつけたり、触ったりすると、その部位が黒く変色します。

　カクミノシメジの傘や柄の色は、こげ茶、薄茶、クリーム色から白っぽいものまでさまざまあります。
　ヒダは離生しているが、湾生あるいは直生状垂生に見える。
　柄は中空で、下部がこん棒状に膨らんでいる。
　触ったり傷つけると傘・柄・ヒダが黒変します。
　胞子紋は白色、胞子はほぼイチジク形〜三角形、
　5.5〜8.5×4.5-6.5 μm。


［似たきのこ］
　→　スミゾメシメジ は柄の根もとに剛毛状の菌糸がある。胞子は紡錘状楕円柄形、８〜９×4.5-5.5 μm。
　→　セイヨウカクミノシメジ
　→　ヒシノミスミゾメシメジ の胞子は菱形
　→　ハタケシメジ は触れても黒変しない。

［紛らわしい毒キノコ］
　→　クサウラベニタケ、ネズミシメジ